在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

论述报告

1、从光敏教育培养细胞膜中转化成DNA化学交联核苷酸质

为了能分离出来光交连球蛋清质含量-DNA组合物适用LC-MS具体研究，笔者开发设计了种性变纯化方式，可从DNA中去要不是交连球蛋清质含量，仅在直晒时在可以什么是基因组触及生物富集DNA交连球蛋清质含量。用TRIZOL分离出来上色质并彻底清除入狱获的非交连球蛋清，但是将其直接溶于以实施RNase助代谢。在多普勒彩超抗拉所得额球蛋清质含量交连DNA的分离出来物，在硫氰酸胍中烧沸性变，并在二氧化反应硅抽滤柱上急促干洗以去要不是交连球蛋清质含量直到结束。在核酸酶除理从DNA中产生光交连球蛋清，并实施胰球蛋清酶助代谢适用LC-MS具体研究。该的方法名称为球蛋清质含量交连DNA分离出来或XDNAX。

图1.营养物质质交连DNA添加或XDNAX操作流程表（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可可以直接了解DNA的蛋清质图谱

将光化学交联方式 拜谱生物于MCF7肿瘤人体细胞，看到了1,805种备选蛋清，中仅1,191种现实存在于3个或很多次重叠中。60%的DNA上下级效应组可能含有核酸紧密联系的GO标注，在缺乏性核酸紧密联系标注的蛋清质中，较大 的贡献奖出于核纤层蛋清，首先其次是加入复染质组识和肿瘤人体细胞裂变的蛋清质（图2）。

图2 . 可进行排斥 DNA 的蛋清质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3汇报总结了DNA主动反应组所抽象性的球核血清质酶-DNA对话框简述分为的核苷酸热塑肽。这还包括因（1）球状DNA根据实际在一起节构域、（2）DNA 根据实际在一起周期性区（IDR）和（3）因与某个球核血清质酶（列如组球核血清质酶根据实际在一起球核血清质酶）、RNA（列如剪接成分）或相分离处理区室（列如核仁球核血清质酶）主动反应而诱发的的环境靠近。

图3 . 可进行接觸 DNA的组成部分域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、酶联免疫法癌细胞扰动时与DNA整合的转录因素

雌生长性的激素多巴胺受体α（ESR1）驻放在胞质溶胶中，等到发现其配体，引起易位到生殖组织，在在那它与dna组中的特殊地域融合以激发特殊的转录编译程序。将血清饥饿的MCF7生殖组织爆出于高极量雌生长性的激素（10 nM 17β-雌二醇）4420分钟，与模拟机操作的剖析生殖组织比因此的DNA相护能力组（图4A）。中仅，雌生长性的激素激励后DNA相护能力组中的ESR1加强了30倍（图4B）。总的策略而言，在1,814个按量的血清质-DNA相护能力中，约有9%展现出可超过2倍的重要发生改变，并洞察分析到与ESR1还具有相护能力的血清如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌缴素加工乳腺炎癌内部 DNA 共同用处组的一定量较（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

总结

设计进人dna组的蛋清质以很清楚它是如何快速被识别并付诸实践活动的，直到是科研开发成员的短期的认为。dna组可及性最主要以DNA为公司的想法通过设计，然后，到到目前结束结束，染色的质疑胶中的哪些问题蛋清质与DNA 进行物理上的互为选用尚不很清楚。选用零距光交连，可发现DNA互为选用组中的绝大部分数蛋清质，XDNAX技能将算作蛋清质-DNA互为选用设计的强交通工具。

拜谱总结ppt

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的血清质组学、突显组学、消化吸收组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

借鉴期刊论文：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.